6. プログラムおよび講演概要

(プログラムは都合により変更されることがありますので、ご了承ください)

司会: 西島和三 (BSCRC理事、持田製薬（株） 医薬開発本部)

13:30　開会挨拶

13:40 - 14:15　講演1

「知識から知恵へ」

中村春木 大阪大学 蛋白研究所 所長

シミュレーションとビッグデータ解析が、従来の実験・理論による取り組みに対比して、第３、第４の科学とそれぞれ称されトレンドとなっている。科学の目的が自然界の原則・法則を理解する「知恵」を産み出すこととすると、特に生命科学に有効と思われる第３、４の科学のアプローチ法は、従来の第１、２の科学のアプローチ法とは本質的に異なる。その点を明示し、皆様と議論を行いたい。

14:15 - 14:50　講演2 　(pdf:)

「生体分子系における非平衡過程」

田中成典 教授

神戸大学大学院 システム情報学研究科

タンパク質フォールディングやリガンドドッキングを念頭に置いた、ランジュバン・ダイナミクスの理論解析を、古典系から量子系へのマッピングを行うことで系統的に行う。経路積分による定式化に基づいて、問題を拡散量子モンテカルロ法によるシミュレーションに帰着させ、いくつかの典型的なモデルポテンシャルに対して、自由エネルギーの緩和過程を基底状態探索の形で記述する。

14:50 - 15:25　講演3

「粗視化シミュレーションの最前線：現状と課題」

高田彰二 教授

京都大学理学研究科 生物物理教室

構造生物学やゲノムシークエンシングの技術革新は目覚ましく、分子シミュレーション解析のニーズも急激に大規模化している。近年、分解能を落として高速化を図った粗視化シミュレーション研究が盛んである。私たちは、巨大蛋白質・核酸系をシミュレーションできる粗視化モデルと、そのソフトウエアCafeMolを開発してきた。粗視化シミュレーションの現状を概観し、その課題を整理する。

15:25　休憩 (15分)

15:40 - 16:15　講演4 (pdf:)

「計算と光を融合活用した理論分子設計の実現についての調査研究について」

鶴田宏樹 副センター長・准教授

神戸大学 応用構造科学産学連携推進センター

科学技術基盤（スーパーコンピュータ「京」や大型放射光施設「SPring-8」）の融合活用による理論的分子設計手法を強みとした産業の創生と育成における課題抽出と先端研究インフラを活用した産学官連携プロジェクトによる解決手法、社会実装による新しい価値創造の実現に資する調査研究について紹介する。

16:15 - 16:50　講演5　(pdf:)

水口賢司 バイオインフォマティクスプロジェクト プロジェクトリーダー

国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所

ゲノム科学とハイスループット技術の進展に伴い、薬効・毒性に関係する大量の実験データの利用が可能となり、従来型の創薬研究の枠組みは変革を迫られている。我々が指向する、計算生物学によるシステムとしての生体応答の理解を通した創薬研究では、多様なデータの統合と、計算化学的手法を含む大規模計算とを組み合わせることが必須であり、その具体的な取り組みを紹介したい。

16:50 - 17:25　講演6　(pdf:)

「スーパーコンピュータの将来」

小柳義夫　特命教授

神戸大学 計算科学教育センター

科学技術計算を主要な目的とする高性能計算機「スーパーコンピュータ」は、 1970年代から急速に発展し、現在、1 PFlops（1秒間に10^15回計算できる性能） を越えるスーパーコンピュータは、世界で60台を越えている。我が国でもポス ト「京」プロジェクトが進められている。今後どこまで発展するのか、何が問題なのか、これにより何が可能になるのかを明らかにしたい。

17:30　終了